Formation Continue : Initiation à la Chemoinformatique


    Durée

    5 jours


    Calendrier

    du 16 Mai 2010 à 9h au 20 Mai 2010 à 16 h


    Personnes concernées

    Chimistes (Bac+3 ou plus), techniciens supérieurs (DUT) ayant une expérience en gestion des bases de données, logiciels de modélisation, souhaitant élargir leur domaine de compétence. La Chemoinformatique est un nouveau domaine apparu il y a quelques années. Il concerne (i) le stockage, la gestion et la recherche de données chimiques (bases de données), (ii) le développement de modèles prédictifs reliant la structure chimique de molécules avec leurs propriétés physico-chimiques et biologiques, et, (iii) le design in silico de nouveaux composés possédant les propriétés désirées. Les approches Chemoinformatique sont trés utilisées dans l’industrie pharmaceutique pour effectuer un criblage virtuel, optimiser un lead ainsi que pour des prédictions de propriétés ADME/Tox.


    Pré-requis

    Connaissance de base de l’environnement Windows.


    Langue

    Les cours seront délivrés en Anglais ou Français en fonction de l’audience.


    Lieu

    Université de Strasbourg

    Faculté de Chimie

    1, rue Blaise Pascal

    67070 STRASBOURG

    L’enseignement se déroulera au sein de la Faculté de Chimie, dans une salle réservée à cette formation, équipée de 21 PC en double boot Windows/LINUX, de 4 stations de travail SGI, d’une imprimante et d’un vidéo projecteur.

    Programme

    • Représentation de structures chimiques par ordinateur et formats électroniques d’échange
    • Systèmes de gestion des bases de données en chimie.
    • Descripteurs, pharmacophores, espace chimique
    • Similarité, diversité, clustering : conception et analyse de chimiothéque.
    • Modèles QSAR de classification (Arbres de Décision, SVM, Réseaux de Neurones) et de régression (MLR, PLS)
    • Validation et domaine d’applicabilité des modèles QSAR
    • Docking. Criblage virtuel, sélection des hits. Optimisation d’un lead.

    Logiciels utilisés dans les cours

    ChemAxon, ISIDA, WEKA, MOE, LigandScout, LeadIT.


    Frais de participation

    1.605 €

    Cette participation inclu : l’enseignement et les repas de midi

    Renseignements et inscriptions

    DEPULP

    Caroline BERST

    Tél. : 03 90 24 49 21

    Sauf vendredi aprés-midi

    Fax : 03 90 24 49 29

    c.berst AT depulp.com
    Responsable scientifique

    Alexandre Varnek, Professeur à la Faculté de Chimie.

    Courriel : varnek AT chimie.u-strasbg.fr